省直事业单位和市直事业单位在编制上是没有区别的，无非就是上级部门的差别，省直事单位的上级一般都是政府部门，比如某某所，而市直事业单位就是市直属事业单位的上一级一般为某福利工厂，一般是为市政府部门直属的。

所以在管理和晋升上，说没有区别的，大部分岗位都是参照公务员来进行管理的，但是不管是省直还是市直，同等情况下晋升是比公务员差很多的，提拔极其困难。待遇方面，不一定省级比市级好，主要看单位有无创收以及上级的重视程度;事业单位改革，市级的比较有可能波及，事业单位没有行政权力，因此省级和市级事业单位没有本质区别，主要看事业单位的职能和工作性质。省级单位是省政府或者各厅下属的，由省财政发工资，市级事业单位是市政府或者各局下属的，由市财政发工资。