对于有编制的人员来说工资待遇是有保证的，没有编制的人员在事业单位工作的工资待遇会差一些，主要表现为绩效工资、住房公积金、年终奖金等方面。

对于有编制的工作人员可以考取或者评定职称，升职的希望会更大，对于没有编制的工作人员有可能工作几年都仍然是普通科员，与职位相关的各种福利待遇都会受到一定的限制。

有编制的工作人员通常会有投票权，在竞争上岗、年终互评等情况下都有一定的话语权，虽然并不是非常大的权力，但至少可以发表个人的意见。没有编制的工作人员通常没有投票权，所以同事的态度通常会差一些。

没有编制的工作人员往往要承担更大的工作量，如果不做会随时面临被解雇的风险，对于有编制的工作人员则不会出现这种情况，甚至年纪较大或者年资较长的人会出现领导叫不动的情况。