科长的级别高一些。科长在公务员的行政等级内属于九至十三级，一般可以说为市级的下属单位，而股长属于基层的管理级别的骨干成员，只能说出是县级下属单位。

科长比股长级别高

科长是指一般行使政府给予的职能，属于有责任的部门担任者。在企业中，科长属于中层管理干部。在中国国家公务员体系中处于9-13级。股长是最基层的管理骨干，公务员系列中，就设有股长这个职务级别。

过去省军级，地师级，县团级。省市县下属都有局，但局的级别不一样。为区分局下面单位，省局下属是处，市局下属是科，县局下属是股。团政治部有组织、宣传、群工等股；后勤处和装备处则有战勤、卫生、营房、军需、油料、技术等股。一般来说股长都是副营职或者正连职。而地方上的股级，则是在科下面设立的。这是一个未入流的级别，也并不在国家公务员级别之内，实际上就是科员级别。