舅舅有案底一般不会影响外甥考公务员。根据公务员政审规定：直系血亲中或对本人有较大影响的旁系血亲中有被判处死刑或者正在服刑的属于政审不合格，不能录取的。我国不实行连作制度，因此可以考公务员。

公务员政治审查主要强调考生本人思想进步、品德优良、作风正派，有较强的组织纪律性和法制观念。

一般有下列情形之一的，属政审不合格：

有反对四项基本原则言行的；

有流氓、偷窃等不良行为，道德品质不好的；

有犯罪嫌疑尚未查清的；

直系血亲或对本人有较大影响的旁系血亲在境外、国外从事危害我国国家安全活动，本人与其划不清界限的；

直系血亲中或对本人有较大影响的旁系血亲中有被判处死刑或者正在服刑的；

并且，为了保证录用考核工作顺利进行，各地根据需要可成立临时性的考核工作班子，具体负责录用考核的组织协调工作。